Paket: bcftools (1.22-1)

Links für bcftools

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket bcftools herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [samtools.github.io]

Aufruf und Manipulation genomischer Varianten von VCF/BCF-Dateien

BCFtools ist eine Reihe von Dienstprogrammen, die Variantenaufrufe im Variant Call Format (VCF) und dessen binärem Gegenstück BCF bearbeiten. Alle Befehle arbeiten transparent mit VCFs und BCFs, sowohl unkomprimiert als auch BGZF-komprimiert.

Markierungen: Implementiert in: C, Rolle: Programm

Andere Pakete mit Bezug zu bcftools

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libhts3t64 (>= 1.22.1+ds-1)

C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate
dep: sse2-support [i386]

CPU feature checking - require SSE2

rec: perl

Larry Wall's Practical Extraction und Report Language
rec: python3-gffutils

Work with GFF and GTF files in a flexible database framework
rec: python3-matplotlib

Python-System ähnlich Matlab zur Ausgabe von Zeichnungen

sug: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
sug: python3-numpy

Python library for numerical computations (Python 3)
sug: texlive-latex-recommended

TeX Live: LaTeX recommended packages

bcftools herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	810,0 kB	2.872,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	730,1 kB	4.293,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	713,2 kB	3.921,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	856,6 kB	2.970,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	844,8 kB	4.797,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	797,3 kB	2.348,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	830,0 kB	2.927,0 kB	[Liste der Dateien]