Alle Optionen
trixie  ] [  forky  ] [  sid  ]
[ Quellcode: htslib  ]

Paket: libhts3t64 (1.22.1+ds2-1)

Links für libhts3t64

Screenshot

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket htslib herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Ähnliche Pakete:

C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

HTSlib ist eine Implementierung einer vereinheitlichten C-Bibliothek für den Zugriff auf gängige Dateiformate, wie SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM und VCF (Variant Call Format), die für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten verwendet werden, und ist die von samtools und bcftools verwendete Kernbibliothek. HTSlib hängt nur von zlib ab. Es ist bekannt, dass sie mit gcc, g++ und clang kompatibel ist.

HTSlib implementiert einen verallgemeinerten BAM-Index (binary SAM) mit der Dateierweiterung »csi« (coordinate-sorted index). Der HTSlib-Dateileser sucht zuerst nach dem neuen Index und dann nach dem alten, wenn der neue Index nicht vorhanden ist.

Andere Pakete mit Bezug zu libhts3t64

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • erweitert

libhts3t64 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Paketgröße Größe (installiert) Dateien
amd64 487,4 kB1.232,0 kB [Liste der Dateien]
arm64 423,6 kB1.276,0 kB [Liste der Dateien]
armhf 406,5 kB1.015,0 kB [Liste der Dateien]
i386 503,7 kB1.251,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 498,6 kB1.595,0 kB [Liste der Dateien]
riscv64 467,6 kB944,0 kB [Liste der Dateien]
s390x 459,9 kB1.199,0 kB [Liste der Dateien]