Paket: cassiopee (1.0.9-3 und andere)

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Quellcode-Paket cassiopee herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

index and search tool in genomic sequences

Cassiopee index and search library C implementation. It is a complete rewrite of the ruby Cassiopee gem. It scans an input genomic sequence (dna/rna/protein) and search for a subsequence with exact match or allowing substitutions (Hamming distance) and/or insertion/deletions.

This package contains the cassiopee and cassiopeeknife tools.

Andere Pakete mit Bezug zu cassiopee

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.14)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libcassie1v5 (>= 1.0.9)

library implementating search algorithms
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC Support-Bibliothek
dep: libgoogle-glog0v6 (>= 0.6.0~rc1)

Bibliothek, die auf der Anwendungsebene protokolliert
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

cassiopee herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.0.9-3+b2	17,8 kB	76,0 kB	[Liste der Dateien]