[ ソース: cassiopee ]
パッケージ: cassiopee (1.0.9-3 など)
index and search tool in genomic sequences
Cassiopee index and search library C implementation. It is a complete rewrite of the ruby Cassiopee gem. It scans an input genomic sequence (dna/rna/protein) and search for a subsequence with exact match or allowing substitutions (Hamming distance) and/or insertion/deletions.
This package contains the cassiopee and cassiopeeknife tools.
その他の cassiopee 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.14)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libcassie1v5 (>= 1.0.9)
- library implementating search algorithms
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgoogle-glog0v6 (>= 0.6.0~rc1)
- library that implements application-level logging.
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3