Package: seqan-needle (1.0.2+ds-2)
Links for seqan-needle
Debian Resources:
Download Source Package seqan-needle:
- [seqan-needle_1.0.2+ds-2.dsc]
- [seqan-needle_1.0.2+ds.orig.tar.xz]
- [seqan-needle_1.0.2+ds-2.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Forhåndsfilter for optælling af meget store samlinger af nukleotidsekvenser
Needle er et værktøj for semikvantitativ analyse af meget store samlinger af nukleotidsekvenser.
Needle lagrer sine data i flere indflettede Bloomfiltre, er hurtig og pladseffektiv i sin sandsynlighedsdatastruktur og bruger et vinduesskema (også kaldt minimeringsprogrammer) til at reducere mængden af data lagret. Hvor mange indflettede Bloomfiltre der bruges er defineret af brugeren. Hvert indflettet Bloomfilter har en såkaldt udtrykstærskel og lagrer minimeringsprogrammer med en hændelse større end eller lig med sin egen udtrykstærskel og mindre end den næststørste udtrykstærskel (hvis der er ingen større udtrykstærskel, alle større end eller ligmed tærsklen lagres). Disse udtrykstærskler bruges så under forespørgslen (kaldt estimat) til at tilnærme udtryksværdier for givne udskrifter.
Other Packages Related to seqan-needle
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
Download seqan-needle
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| riscv64 | 338.1 kB | 832.0 kB | [list of files] |