[ Source: ragout ]
Package: ragout-examples (2.3-5)
Links for ragout-examples
Debian Resources:
Download Source Package ragout:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Reference-assisteret redskab til ordning af genomrækkefølge - eksempler
Ragout (Reference-Assisted Genome Ordering UTility) er et værktøj for kromosomniveauopsætning via flere referencer. Givet oprindelig samlingsfragmenter (contigs/scaffolds) og en eller flere relaterede referencer (fuldstændig eller i uddrag) fremstilles en kromosomskalasamling (som et sæt af scaffolds).
Fremgangsmåden er baseret på analyse af genom-omarrangementer (som inversioner eller kromosomale translokationer) mellem inddatagenomer og rekonstruktion af den mest sparsommelige struktur for målgenomet.
Ragout understøtter nu både små og store genomer (i pattedyrskala og - kompleksitet). Samlingen af højt polymorfiske genomer er i øjeblikket begrænset.
Denne pakke indeholder eksempler på data til at teste ragout.
Download ragout-examples
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 18,002.3 kB | 18,024.0 kB | [list of files] |