Package: pirs (2.0.2+dfsg-12 and others)
Links for pirs
Debian Resources:
Download Source Package pirs:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Profilbaseret Illumina-læsesimulator for pair-end
Programmet pIRS kan bruges til at simulere Illumina PE-læsninger, med en serie af tegn oprettet af Illumina-sekventeringsplatformen, såsom indsæt størrelsesdistribution, sekventeringsfejl (erstatning, indsættelse, sletning), kvalitetsbedømmelse og GC content-coverage-bias.
Indsæt-størrelsen følger en normal distribution, så brugere bør sætte middelværdien og standardafledningen. Normalt er standardafledningen sat som 1/20 af middelværdien. Normaldistributionen af Box-Muller-metoden er simuleret.
Programmet simulerer sekventeringsfejl, kvalitetsbedømmelse og GC content-coverage-bias jævnfør den empiriske distributionsprofil. Nogle standardprofiler talt fra en masse reelle sekventeringsdata tilbydes.
For at simulere læsninger fra diploid-genom bør brugere simulere diploid-genomsekvensen først ved at angive forholdet for heterozygosis SNP, heterozgyosis InDel og strukturvariation.
Other Packages Related to pirs
|
|
|
|
-
- dep: fonts-liberation
- Skrifttyper med samme måleenheder som Times, Arial og Courier
-
- dep: gnuplot [x32]
- Kommandolinjedrevet interaktivt grafprogram
also a virtual package provided by gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
-
- dep: gnuplot-qt [not x32]
- Kommandolinjedrevet interaktivt grafprogram - QT-pakke
- or gnuplot
- Kommandolinjedrevet interaktivt grafprogram
also a virtual package provided by gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
-
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, arm64, ia64, loong64, riscv64, sh4, x32]
- dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]
- dep: libc6 (>= 2.38) [arm64, riscv64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, sh4]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [x32]
- Package not available
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: libgzstream0 [x32]
- Tilbyd funktionalitet for zlib C-bibliotek i en C++-iostrøm
- dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg) [not arm64, riscv64, x32]
- dep: libgzstream0 (>= 1.5+git20171107.9a20658) [arm64, riscv64]
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not x32]
- GNU Standard C++ bibliotek v3
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [x32]
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid
-
- dep: pirs-profiles
- Profilbaseret Illumina-læsesimulator for pair-end - profildata
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
Download pirs
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 2.0.2+dfsg-12 | 112.4 kB | 424.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 2.0.2+dfsg-12 | 116.7 kB | 390.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 2.0.2+dfsg-12+b2 | 108.8 kB | 423.0 kB | [list of files] |
| armel | 2.0.2+dfsg-12 | 102.8 kB | 352.0 kB | [list of files] |
| armhf | 2.0.2+dfsg-12 | 102.6 kB | 304.0 kB | [list of files] |
| hppa (unofficial port) | 2.0.2+dfsg-12 | 115.1 kB | 371.0 kB | [list of files] |
| i386 | 2.0.2+dfsg-12 | 122.5 kB | 392.0 kB | [list of files] |
| ia64 (unofficial port) | 2.0.2+dfsg-12 | 134.5 kB | 566.0 kB | [list of files] |
| loong64 (unofficial port) | 2.0.2+dfsg-12 | 109.1 kB | 391.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 2.0.2+dfsg-12 | 113.6 kB | 396.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 2.0.2+dfsg-12 | 115.4 kB | 432.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 2.0.2+dfsg-12 | 118.0 kB | 486.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 2.0.2+dfsg-12 | 117.0 kB | 422.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 2.0.2+dfsg-12+b2 | 113.5 kB | 335.0 kB | [list of files] |
| s390x | 2.0.2+dfsg-12 | 113.8 kB | 390.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 2.0.2+dfsg-12 | 127.7 kB | 421.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 2.0.2+dfsg-12 | 104.6 kB | 2,219.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 2.0.2+dfsg-6 | 110.1 kB | 377.0 kB | [list of files] |