Package: r-bioc-variantannotation (1.24.2-1) [debports]

Links for r-bioc-variantannotation

Debian Resources:

Bug Reports

Download Source Package :

Not found

Maintainers:

External Resources:

Homepage [bioconductor.org]

Similar packages:

BioConductor-annotation af genetiske varianter

Denne BioConductor-pakke tilbyder R-funktioner til at annotere varianter, beregne ændring af aminosyrekodning og forudsige kodningsresultater.

Other Packages Related to r-bioc-variantannotation

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.15)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: r-api-3.4

Package not available
dep: r-base-core (>= 3.4.3-1)

GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem
dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.27.9)

GNU R Annotation Database-grænseflade for BioConductor
dep: r-bioc-biobase

Grundlæggende funktioner for Bioconductor
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.15.3)

Generiske funktioner for Bioconductor
dep: r-bioc-biostrings (>= 2.33.5)

GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser
dep: r-bioc-bsgenome (>= 1.37.6)

BioConductor-infrastruktur for Biostrings-baserede arvemassepakker
dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.11.4)

BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer
dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.27.4)

GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer
dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.27.6)

BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller
dep: r-bioc-iranges (>= 2.3.25)

GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller
dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.23.10)

GNU R-binær sammenligning (BAM), variantkald (BCF) eller tabix-filimport
dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.25.16)

GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor
dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.13.13)

BioConductor S4-implementering af vektorer og lister
dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.5.3)

BioConductor - assay-container
dep: r-bioc-xvector (>= 0.5.6)

BioConductor-repræsentation og manipulering af eksterne sekvenser
dep: r-cran-dbi

GNU R-pakke der tilbyder en generisk databasegrænseflade
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Komprimeringsbibliotek - kørselstid

sug: r-bioc-annotationhub

GNU R-klient til at tilgå AnnotationHub-ressourcer
sug: r-bioc-snpstats

BioCondutor - SnpMatrix- og XSnpMatrix-klasser og metoder
sug: r-cran-ggplot2

Implementering af Grammar of Graphics
sug: r-cran-runit

GNU R-pakke der tilbyder en ramme for enhedstest

Download r-bioc-variantannotation

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
m68k (unofficial port)	2,311.9 kB	2,941.0 kB	[list of files]