Package: concavity (0.1+dfsg.1-5) [debports]

Links for concavity

Debian Resources:

Bug Reports

Download Source Package :

Not found

Maintainers:

External Resources:

Homepage [compbio.cs.princeton.edu]

Similar packages:

Forudsigelse af proteinligandbindingssteder fra struktur og bevaring

ConCavity forudser proteinligandbindingssteder ved at kombinere evolutionær sekvensbevaring og 3D-struktur.

ConCavity bruger en PDB-formateret proteinstruktur og ekstra filer, som karakteriserer bevarelsen af kæderne for den evolutionære sekvens i strukturfilen.

De følgende resultatfiler laves som standard:

 * Restligandbindende forudsigelser for hver kæde (*.scores).
 * Restligandbindende forudsigelser i en PDB-formatfil (restbedømmelser
   placeres i temp.-faktorfeltet, *_residue.pdb).
 * Pocket-forudsigelsesplaceringer i en DX-formatfil (*.dx).
 * PyMOL-skript til at visualisere forudsigelserne (*.pml).

Other Packages Related to concavity

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1)

GCC støttebibliotek
dep: libstdc++6 (>= 5)

GNU Standard C++ bibliotek v3

sug: conservation-code

Værktøj til bedømmelse af bevaring af proteinsekvens
sug: pymol

System til molekylærgrafik

Download concavity

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
m68k (unofficial port)	235.2 kB	976.0 kB	[list of files]