[ Source: prime-phylo ]
Package: prime-phylo (1.0.11-11)
Links for prime-phylo
Debian Resources:
Download Source Package prime-phylo:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [prime.sbc.su.se]
Similar packages:
Bayesiansk estimation af gentræer der tager højde for artstræet
PrIME (Probabilistic Integrated Models of Evolution) er en pakke, der understøtter slutning af evolutionære parametre i en bayesiansk ramme ved hjælp af Markov-kædens Monte Carlo-simulering. Et kendetegn ved PriME er, at artstræet tages i betragtning ved analyse af gentræer.
Inddataene for PrIME er en flersekvenssammenligning i formatet FASTA og resultatet indeholder træer i formatet Newick.
Other Packages Related to prime-phylo
|
|
|
|
-
- dep: libblas3
- Grundlæggende reference-implementeringer til lineær algebra, delt bibliotek
- or libblas.so.3
- virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libboost-mpi1.83.0 (>= 1.83.0)
- C++-grænseflade til Message Passing Interface (MPI)
-
- dep: libboost-serialization1.83.0 (>= 1.83.0)
- Serialiseringsbibliotek for C++
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: liblapack3
- Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - delt version
- or liblapack.so.3
- virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)
- Bibliotek til beskedvideresendelse med høj ydelse - delt bibliotek
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: libxml2 (>= 2.7.4)
- XML-bibliotek til GNOME
-
- dep: perl
- Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
-
- sug: mafft
- Program til justering af flere aminosyrer eller nukleotide sekvenser
-
- sug: mrbayes
- Bayesiansk inferens for fylogeni
-
- sug: muscle
- Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser
-
- sug: njplot
- Fylogenetisk trætegningsprogram
-
- sug: phyml
- Fylogenisk estimering der bruger maksimum lIkelihood
-
- sug: probalign
- Multiple sekvensjustering med brug partitionsfunktionel posteriore sandsynligheder
-
- sug: python3-biopython
- Python 3-bibliotek for bioinformatik
-
- sug: raxml
- Randomized Axelerated Maximum Likelihood for pylogenetiske træer
-
- sug: treeviewx
- Viser og udskriver fylogenetiske træer
Download prime-phylo
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| i386 | 884.5 kB | 3,176.0 kB | [list of files] |