Package: seqtk (1.4-2) [debports]

Hurtigt letvægtsværktøj til behandling af sekvenser i formaterne FASTA eller FASTQ

I øjeblikket understøtter seqtk en kvalitetsbaseret justering med algoritmen phred, konvertering fra fastq til fasta, komplementering af omvendte sekvenser, udpakning eller maskering af delsekvender i regioner, der stammer fra en BED/navneliste-fil, og mere. Den indeholder et modul til at indsamle delvise prøver, der indsamler eksakt n sekvenser eller en fraktion af sekvenser.

Seqtk understøtter både inddatafiler af typen fasta og fastq, der valgfrit kan komprimeres med gzip.

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):