Package: r-bioc-structuralvariantannotation (1.18.0+ds-1)

Links for r-bioc-structuralvariantannotation

Debian Resources:

Download Source Package r-bioc-structuralvariantannotation:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [bioconductor.org]

Similar packages:

Variantannotationer for strukturelle varianter

StructuralVariantAnnotation indeholder nyttige hjælpefunktioner for håndtering af strukturelle varianter i VCF-format. Pakkerne indeholder funktioner til at fortolke VCF'er fra et antal populære kaldere samt funktioner til at håndtere stoppunkter involverende to separate genomiske loci kodet som GRange-objekter.

Other Packages Related to r-bioc-structuralvariantannotation

depends

recommends

suggests

enhances

dep: r-api-4.0

virtual package provided by r-base-core
dep: r-api-bioc-3.18

virtual package provided by r-bioc-biocgenerics
dep: r-bioc-biocgenerics

Generiske funktioner for Bioconductor
dep: r-bioc-biostrings

GNU R-strengobjekter der repræsenterer biologiske sekvenser
dep: r-bioc-genomeinfodb

BioConductor-redskaber til at manipulere kromosomidentifikatorer
dep: r-bioc-genomicfeatures

GNU R-værktøjer til at lave og manipulere transcript centric-annotationer
dep: r-bioc-genomicranges

BioConductor-repræsentation og manipulation af genomiske intervaller
dep: r-bioc-iranges

GNU R - containere på lavt niveau til at lagre sæt af heltalsintervaller
dep: r-bioc-rtracklayer

GNU R-grænseflade til genombrowsere og deres annotationsspor
dep: r-bioc-s4vectors

BioConductor S4-implementering af vektorer og lister
dep: r-bioc-summarizedexperiment

BioConductor - assay-container
dep: r-bioc-variantannotation

BioConductor-annotation af genetiske varianter
dep: r-cran-assertthat

GNU R easy pre and post assertions
dep: r-cran-dplyr

GNU R-grammatik for datamanipulering
dep: r-cran-rlang

Funktioner for basistyper samt Core R- og »Tidyverse«-funktioner
dep: r-cran-stringr

Gør det nemmere at arbejde med strenge

sug: r-bioc-biovizbase

GNU R-grundlæggende grafiske redskaber for visualsiering af genomiske data
sug: r-bioc-ggbio

Visualization tools for genomic data
sug: r-cran-devtools

Værktøjer til at gøre udvikling af R-pakker hurtigere
sug: r-cran-ggplot2

Implementering af Grammar of Graphics
sug: r-cran-knitr

GNU R-pakke for dynamisk rapportoprettelse via Literate Programming
sug: r-cran-rmarkdown

convert R markdown documents into a variety of formats
sug: r-cran-roxygen2

in-line documentation for GNU R
sug: r-cran-testthat (>= 2.1.0)

GNU R-testpakke
sug: r-cran-tidyverse

Easily Install and Load the 'Tidyverse'

Download r-bioc-structuralvariantannotation

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	392.5 kB	1,298.0 kB	[list of files]