[ Source: smrtanalysis ]
Package: smrtanalysis (0~20210112)
Links for smrtanalysis
Debian Resources:
Download Source Package smrtanalysis:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [www.pacb.com]
Similar packages:
Programpakke for enkel molekyle, realtids sekventering
SMRT®-analyse er en funktionsrig programpakke indenfor bioinformatik udviklet i åben kildekode og tilgængelig for analyse af DNA- sekventeringsdata fra Pacific Biosciences' SMRT-teknologi. Brugere kan vælge blandt en række analyseprotokoller, som udnytter PacBio® og tredjepartsværktøjer. Analyseprotokoller inkluderer de novo-genomsamling, cDNA-oversættelse, DNA base-ændringsregistrering og lang-amplicon analyse til at bestemme fasede konsensussekvenser.
Dette er en metapakke, som afhænger af komponenterne for SMRT Analysis.
Other Packages Related to smrtanalysis
|
|
|
|
-
- dep: blasr
- Kortlægning af enkelte molekylesekventeringslæsninger
-
- dep: pbbamtools
- Behandling af Pacific Biosciences binære sammenlignings-/oversættelsesfiler
-
- dep: pbdagcon
- sequence consensus using directed acyclic graphs
-
- sug: falcon
- Package not available
-
- sug: kineticstools
- Detektion af DNA-ændringer
-
- sug: pbalign
- Package not available
-
- sug: pbbarcode
- Package not available
-
- sug: pbgenomicconsensus
- Package not available
-
- sug: pbh5tools
- Package not available
Download smrtanalysis
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| all | 3.1 kB | 9.0 kB | [list of files] |