Package: python3-denss (0.0.1+20200710gac8923a-2)

Beregn elektrontæthed ud fra en opløsningsspredningsprofil

DENSS er en algoritme, der bruges til at beregne ab initio elektrontæthedskort direkte fra opløsningsspredningsdata. DENSS implementerer en ny iterativ strukturfaktorhentningsalgoritme til at skifte mellem reel rumtæthed og reciprokke rumstrukturfaktorer, og anvender passende begrænsninger i hvert domæne for at opnå et sæt strukturfaktorer hvis intensitet er i overensstemmelse med eksperimentelle data, og hvis elektrontæthed er i overensstemmelse med forventede reelle rumegenskaber for partikler.

DENSS bruger NumPy Fast Fourier Transform til at bevæge sig mellem reelle og reciprokke rumdomæner. Hvert domæne er repræsenteret af et gitter af punkter (kartesisk), N x N x N. N bestemmes af størrelsen af ​​systemet og den ønskede opløsning. Den reelle rumstørrelse af kassen bestemmes af partiklens maksimale dimension, D, og ​​det ønskede prøveforhold. Større prøveforhold resulterer i en større reel rumkasse og derfor en højere prøve i reciprokt rum (dvs. afstanden mellem datapunkter i q). Mindre voxel-størrelse i reelt rum svarer til højere rumlig opløsning og derfor til større q-værdier i reciprokt rum.

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):