Package: gmap (2024-11-20+ds-2)

Links for gmap

Debian Resources:

Download Source Package gmap:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Shaun Jackman (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Alexandre Mestiashvili (QA Page)
Étienne Mollier (QA Page)

External Resources:

Homepage [research-pub.gene.com]

Similar packages:

Opdelt og SNP-overholdende justering for mRNA og korte læsninger

Denne pakke indeholder programmerne GMAP og GSNAP samt redskaber til at håndtere genomdatabaser i GMAP/GSNAP-formatet. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) er et værktøj til at sammenligne EST-, mRNA- og cDNA-sekvenser. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) er et værktøj til at sammenligne single-end og paired-end transkriptom-læsninger. Begge værktøjer kan bruge en database med

 * kendte splice-sider og identify novel splice-sider
 * kendte single-nucleotide polymorphisms (SNPs)

GSNAP kan sammenligne bisulfit-behandlet DNA.

Tags: Field: Biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Role: Program, Purpose: Analysing

Other Packages Related to gmap

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libbz2-1.0

højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: perl

Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download gmap

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	33,685.8 kB	268,823.0 kB	[list of files]
arm64	6,907.0 kB	61,267.0 kB	[list of files]
armhf	4,903.1 kB	44,860.0 kB	[list of files]
i386	5,168.3 kB	46,588.0 kB	[list of files]
ppc64el	7,108.9 kB	63,635.0 kB	[list of files]
riscv64	6,359.3 kB	59,311.0 kB	[list of files]