[ Source: bwa ]
Package: bwa (0.7.19-1)
Links for bwa
Debian Resources:
Download Source Package bwa:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Charles Plessy (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Carlos Borroto (QA Page)
- Ognyan Kulev (QA Page)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
External Resources:
- Homepage [bio-bwa.sourceforge.net]
Similar packages:
Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) er en programpakke, for oversættelse af lavafvigende sekvenser mod en stor referencearvemasse, såsom den menneskelige arvemasse. Den består af tre algoritmer: BWA-backtrack, BWA-SW og BWA-MEM. Den første algoritme er designet for Illunina-sekvenslæsninger op til 100 bp, mens de sidste to er for længere sekvenser fra 70 bp til 1 Mbp. BWA-MEM og BWA-SW deler funktioner såsom understøttelse af long-read og opdelingssammenligning, men BWA-MEM, som er den seneste, anbefales generelt for højkvalitets forespørgsler, da den er hurtigere og mere præcis. BWA-MEM har også bedre ydelse end BWA-backtrack for 70-100 bp Illumina-læsninger.
Other Packages Related to bwa
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [not armhf]
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armhf]
-
- rec: perl
- Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
-
- sug: samtools
- Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater
Download bwa
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 207.6 kB | 461.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 194.0 kB | 449.0 kB | [list of files] |
| armhf | 194.3 kB | 384.0 kB | [list of files] |
| i386 | 231.1 kB | 520.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 230.5 kB | 577.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 214.9 kB | 377.0 kB | [list of files] |
| s390x | 222.8 kB | 513.0 kB | [list of files] |