Package: bitseq (0.7.5+dfsg-7)

Links for bitseq

Debian Resources:

Download Source Package bitseq:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

Bayesiansk udledning af transkripter fra sekvensdata

BitSeq er et program til at udlede udtryksniveauer på individuelle transkripter fra sekvensdata (RNA-Seq) og estimering af differentiel udtryk (DE) mellem betingelser. En fordel ved denne fremgangsmåde er muligheden for at tage højde for både teknisk usikkerhed og iboende biologisk varians for at undgå falske DE-kald. Det tekniske bidrag til usikkerheden kommer både fra den finitte læse-dybde og den mulige tvetydige kortlægning af læsninger til flere transkripter.

Other Packages Related to bitseq

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.38)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, s390x]

GCC støttebibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, riscv64]
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ bibliotek v3
dep: python3

Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
dep: python3-numpy

Pythonbibliotek til numeriske beregninger - Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

Komprimeringsbibliotek - kørselstid

sug: samtools

Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

Download bitseq

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	351.4 kB	2,047.0 kB	[list of files]
arm64	304.6 kB	2,215.0 kB	[list of files]
armhf	291.9 kB	1,498.0 kB	[list of files]
i386	371.7 kB	2,066.0 kB	[list of files]
ppc64el	350.3 kB	2,599.0 kB	[list of files]
riscv64	336.4 kB	1,451.0 kB	[list of files]
s390x	332.3 kB	2,039.0 kB	[list of files]