[ Source: e-mem ]
Package: e-mem (1.0.1-2)
Links for e-mem
Debian Resources:
Download Source Package e-mem:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [www.csd.uwo.ca]
Similar packages:
Effektiv beregning af Maximal Exact Matches for meget store genomer
E-MEM aktiverer effektiv beregning af Macimal Exact Matches (MEM'er), som ikke bruger fuld tekst-indeks. Algoritmen bruger meget mindre plads og er meget modtagelig for parallelisering. Den kan beregne alle MEM'er med minimumslængden 100 mellem hele menneske- og musegenomet på en 12-kerne maskine på 10 min. og med 2 GB hukommelse; den krævede hukommelse kan være så lav som 600 MB. Kan effektivt behandle genomer i alle størrelser. Omfattende test og sammenligning med de i øjeblikket bedste algoritmer er indeholdt.
Mummer har mange forskellige skripter, hvor et af nøgleprogrammerne er MEM- beregning. I alle skripterne, kan MEM-beregningsprogrammet nemt erstattes med e-mem for bedre ydelse.
Other Packages Related to e-mem
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.4)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.5)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- enh: mummer
- Effektiv sekvensjustering for hele genomer
Download e-mem
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| armhf | 35.0 kB | 85.0 kB | [list of files] |