all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  sid  ]
[ Source: freecontact  ]

Package: libfreecontact0v5 (1.0.21-7 and others)

Links for libfreecontact0v5

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package freecontact:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Hurtig protein-kontaktprædiktor - bibliotek

FreeContact er en protein-kontaktrestprædiktor optimeret til hastighed. Dens indgang er en flersekvensopstilling. FreeContact kan fungere som en accelereret erstatning for de offentliggjorte kontaktprædiktorer EVfold-mfDCA af DS. Marks (2011) og PSICOV af D. Jones (2011).

FreeContact accelereres af en kombination af vektorinstruktioner, flere tråde og hurtigere gennemførelse af centrale dele. Afhængig af opstillingen er 8-fold eller højere hastighedsforøgelser mulige.

En tilstrækkelig stor tilpasning er påkrævet for meningsfulde resultater. Som minimum bør en opstilling med et effektivt (efter-vægtning) sekvensantal større end længden af søgesekvensen anvendes. Opstillinger med titusinder af (effektive) sekvenser betragtes som gode inddata.

Jackhmmer(1) fra hmmer-pakken eller hhblits(1) fra hhsuite kan anvendes til at oprette opstillingerne, f.eks.

Denne pakke indeholder det delte bibliotek, der implementerer freecontact.

Other Packages Related to libfreecontact0v5

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download libfreecontact0v5

Download for all available architectures
Architecture Version Package Size Installed Size Files
arm64 1.0.21-7+b1 64.9 kB165.0 kB [list of files]