all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: openms  ]

Package: topp (2.6.0+cleaned1-3)

Links for topp

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package openms:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Sæt af programmer der implementerer OpenMS Proteomic Pipeline

TOPP (the OpenMS proteomic pipeline) er en datakanal for analyse af HPLC/MS-data. Programmet består af et sæt af mange små programmer, som kan kædes sammen for at oprette analysedatakanaler skræddersyet for et specifik problem. Programmerne gør brug af biblioteket libopenms. Nogle eksempler på disse programmer er:

 - TOPPView: En fremviser for massespektrometri-data.
 - TOPPAS: En assistent for grafisk brugerflade-drevne TOPP-
           arbejdsforløbdesign.
 - DTAExtractor: Udtrækker spektra for en MS-kørselsfil til flere
                 filer i DTA-format.
 - FileConverter: Konverterer mellem forskellige MS-filformater.
 - FileFilter: Udtrækker eller manipulerer dele af data fra peak-,
   feature- eller consensus feature-filer.
 - SpectraMerger - Sammenføjer spectra fra et LC/MS-kort, enten
                   efter precursor eller efter RT-blokke.
 - BaselineFilter - Fjerner basislinjen fra profilspectra med brug
                    af et top-hat-filter.
 - InternalCalibration: Anvender en intern kalibrering.
 - PTModel: Træner en model for forudsigelse af proteotypic
            peptider fra et træningssæt.
 - RTPredict: Forudser retentiontider for peptider med en model
              trænet af RTModel.
 - ExecutePipeline: Kør arbejdsforløb oprettet med TOPPAS.

Tags: Interface Toolkit: Qt

Other Packages Related to topp

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download topp

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
s390x 2,761.5 kB17,440.0 kB [list of files]