Package: r-cran-ape (5.4-1-1)
Links for r-cran-ape
Debian Resources:
Download Source Package r-cran-ape:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [cran.r-project.org]
Similar packages:
GNU R-pakke for Analyses of Phylogenetics and Evolution
Denne pakke tilbyder funktioner til at læse, skrive, plotte og manipulere fylogenetiske træer, analysere komparative data i en fylogenetisk ramme, tegnanalyser for forfædre, analyser af diversificering og makroevolution, beregne afstande fra DNA-sekvenser, læse og skrive nukleotidsekvenser samt import fra BioConductor samt flere værktøjer såsom Mantels test, generaliserede himmellinjeplot, grafisk undersøgelse af fylogenetiske data (alex, trex, kronoviz), estimering af absolutte evolutionære hastigheder og ur-lignende træer med ikkesamtidige sekvenser, oversætte DNA til AA-sekvenser og anslå sekvenssammenligninger. Fylogeniestimering kan udføres med metoderne NJ, BIONJ, ME, MVR, SDM og triangle og flere metoder håndterer ufuldstændige afstandsmatricer (NJ*, BIONJ*, MVR* og den tilsvarende trianglemetode). Nogle funktioner kalder eksterne programmer (PhyML, Clustal, T-Coffee, Muscle) hvis resultater returneres til R.
Other Packages Related to r-cran-ape
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: liblapack3
- Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - delt version
- or liblapack.so.3
- virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: r-api-4.0
- virtual package provided by r-base-core
-
- dep: r-base-core (>= 4.0.2-1)
- GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem
-
- dep: r-cran-lattice
- GNU R-pakke for »Trellis«-grafik
-
- dep: r-cran-nlme
- GNU R-pakke for (ikke)lineære mixed effects-modeller
-
- dep: r-cran-rcpp (>= 0.12.0)
- GNU R package for Seamless R and C++ Integration
-
- sug: clustalw
- Global nukleotid eller peptid sekvensjustering
-
- sug: muscle
- Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser
-
- sug: phyml
- Fylogenisk estimering der bruger maksimum lIkelihood
-
- sug: r-cran-expm
- GNU R-beregning af matrix eksponentielle og relaterede mængder
-
- sug: r-cran-gee
- Generalized Estimation Equation Solver
-
- sug: r-cran-igraph
- GNU R-netværksanalyse og visualisering
-
- sug: t-coffee
- Flersekvensjustering
Download r-cran-ape
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| mips64el | 2,145.1 kB | 2,528.0 kB | [list of files] |