[ Source: quicktree ]
Package: libquicktree-dev (2.5-5)
Links for libquicktree-dev
Debian Resources:
Download Source Package quicktree:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Neighbor-Joining-algoritme for fylogenier - udvikling
Quicktree er en effektiv implementering af Neighbor-Joining-algoritmen (PMID: 3447015), der kan rekonstruere fylogenier fra store sammenligninger i tid mindre end universets alder.
QuickTree accepterer både afstandsmatrix og data fra multiple-sequence-alignment. Den første skal være i PHYLIP-format. Den sidste skal være i Stockholm-format, der er standardformet for sammenligning for Pfam-databasen. Sammenligninger i forskellige formater kan konverteres til Stockholm-formatet via programmet sreformat, der er en del af pakken HMMer (hmmer.org).
Tress skrives til standardud, i Newick/New-Hampshire-formatet brugt af PHYLIP og mange andre programmer.
Denne pakke indeholder nogle teksthoveder fra quicktree, der bruges af andre pakker.
Download libquicktree-dev
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| armhf | 22.2 kB | 100.0 kB | [list of files] |