Package: minimap (0.2-5)

Værktøj til omtrentlig oversættelse af lange biosekvenser såsom DNA-læsninger

Minimap er et eksperimentelt værktøj til effektivt at finde flere omtrentlige oversættelsespositioner mellem to sæt af lange biologiske sekvenser, såsom mellem DNA-læsninger og referencegenomer, mellem genomer og mellemlange støjfyldte læsninger. Minimap opretter ikke sammenligninger i øjeblikket og derfor er programmet normalt ti gange hurtigere end andre programmer. Programmet erstatter dog ikke andre programmer men kan være nyttigt, når du hurtigt ønsker at identificere lange omtrentlige matchninger med moderat forskel blandt en stor samling af sekvenser. Til denne opgave er programmet meget hurtigere end eksisterende værktøjer.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, use::calculating, Works with: Biological Sequence

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):