all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: pdb2pqr  ]

Package: pdb2pqr (3.5.2+dfsg-3)

Links for pdb2pqr

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package pdb2pqr:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Præparation af proteinstrukturer for elektrostatiske beregninger

PDB2PQR er en Pythonprogrampakke, som automatiserer mange af de fælles opgaver med at forberede strukturer for kontinuum elektrostatik beregninger. Det giver således et af platformen uafhængigt værktøj til konvertering af proteinfiler i PDB-format til PQR-format. Disse opgaver omfatter:

 * Tilføjelse af et begrænset antal manglende tunge atomer til
   biomolekylære strukturer
 * Bestemmelse af sidekæde pKas
 * Placering af manglende hydrogener
 * Optimering af proteinet til gunstig hydrogenbinding
 * Tildele ladnings- og radiusparametre fra en række kraftfelter

Other Packages Related to pdb2pqr

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download pdb2pqr

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
all 11.4 kB32.0 kB [list of files]