[ Source: htslib ]
Package: libhts3 (1.16+ds-3)
Links for libhts3
Debian Resources:
Download Source Package htslib:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Charles Plessy (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
- Steffen Moeller (QA Page)
- Étienne Mollier (QA Page)
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater
HTSlib er en implementering af et ensartet C-bibliotek for adgang til fælles filformater, såsom SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM og VCF (Variant Call Format), brugt for sekvensdata med høj gennemløb, og er basisbiblioteket brugt af samtools og bcftools. HTSlib afhænger kun af zlib. Det vides at være kompatibelt med gcc, g++ og clang.
HTSlib implementerer et generaliseret BAM-indeks (binær SAM), med filudvidelsen »csi« (coordinate-sorted index). HTSlib-fillæseren kigger først efter nye indeks og så efter gamle hvis et nyt indeks mangler.
Other Packages Related to libhts3
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)
- Simpelt adresseoverførelsesbibliotek for klientsiden - GnuTLS-variant
-
- dep: libdeflate0 (>= 1.0)
- Hurtig, fuld buffer DEFLATE-baseret kompression og dekompression
-
- dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)
- Tilpasset kompression for CRAM og andre
-
- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- Kompressionsbibliotek for XZ-formatet
-
- dep: libssl3 (>= 3.0.0)
- Secure Sockets Layer-værktøjssæt - delte biblioteker
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
Download libhts3
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| mips64el | 377.8 kB | 1,301.0 kB | [list of files] |