all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: ruby-crb-blast  ]

Package: ruby-crb-blast (0.6.9-4)

Links for ruby-crb-blast

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package ruby-crb-blast:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Kør betinget gensidig bedste BLAST

CRB-BLAST er en ny metode til at finde orthologer mellem et sæt af sekvenser og et andet. Dette er specielt nyttigt i genom og transkriptom-annotering.

CRB-BLAST udfører først en standard gensidig bedste BLAST. Det gøres ved at udføre BLAST-sammenligninger af forespørgsel->mål og mål->forespørgsel. Gensidig bedste BLAST-træffere er dem hvor det bedste match for enhver given forespørgselssekvens i forespørgsel->mål-sammenligninger også er det bedste træf for matchningen i omvendt (mål->forespørgsel) sammenligning.

Gensidig bedste BLAST er en meget konservativ måde at tilde orthologer. Hovedopfindelsen i CRB-BLAST er at lære en passende e-værdi-udskæring til anvendelse på hver parvis sammenligning ved at bruge det generelle slægtskab for de to datasæt under sammenligning. Dette gøres ved at tilpasse en funktion til distributionen af e-værdier for sammenligningen over sekvenslængder. Funktionen tilbyder en e-værdi-udskæring for en sekvens med en given længde.

Other Packages Related to ruby-crb-blast

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download ruby-crb-blast

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
all 11.7 kB52.0 kB [list of files]