Package: r-bioc-dnacopy (1.72.3-1)
Links for r-bioc-dnacopy
Debian Resources:
Download Source Package r-bioc-dnacopy:
- [r-bioc-dnacopy_1.72.3-1.dsc]
- [r-bioc-dnacopy_1.72.3.orig.tar.gz]
- [r-bioc-dnacopy_1.72.3-1.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [www.bioconductor.org]
Similar packages:
R-pakke: dataanalyse af DNA-kopinummer
Denne pakke implementerer den cirkulære binære segmenteringsalgoritme (CBS) til at segmentere DNA-kopinummerdata og identificere genomiske regioner med unormal kopinummer.
Denne pakke er lavet til at analysere tabel-DNA-kopinummerdata, der normalt (men ikke altid) kaldes array Comparative Genomic Hybridization-data (array CGH). Pakken implementerer en metode til at finde change-points i disse data, der er punkter hvorefter testen (log) over referenceforhold har ændret placering. Denne model er at change-points korresponderer til positioner hvor det underliggende DNA-kopinummer har ændret sig. Derfor kan change-points bruges til at identificere regioner med opnåede og mistede kopinummer. Der tilbydes også en funktion til at lave relevante plot for disse data.
Other Packages Related to r-bioc-dnacopy
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgfortran5 (>= 10)
- Kørselstidsbibliotek for GNU Fortran-programmer
-
- dep: r-api-4.0
- virtual package provided by r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.16
- virtual package provided by r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-2)
- GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem
Download r-bioc-dnacopy
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| armhf | 365.0 kB | 496.0 kB | [list of files] |