[ Source: libbio-db-hts-perl ]
Package: libbio-db-hts-perl (3.01-4 and others)
Links for libbio-db-hts-perl
Debian Resources:
Download Source Package libbio-db-hts-perl:
- [libbio-db-hts-perl_3.01-4.dsc]
- [libbio-db-hts-perl_3.01.orig.tar.gz]
- [libbio-db-hts-perl_3.01-4.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [metacpan.org]
Similar packages:
Perlgrænseflade til HTS-biblioteket
HTSlib er en implementering af et ensartet C-bibliotek for adgang til fælles filformater, såsom SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM og VCF (Variant Call Format), brugt for sekvensdata med høj gennemløb, og er basisbiblioteket brugt af samtools og bcftools. HTSlib afhænger kun af zlib. Det vides at være kompatibelt med gcc, g++ og clang.
HTSlib implementerer et generelt BAM-indeks (binær SAM), med filendelsen »csi« (coordinate-sorted index). HTSlib-fillæseren kigger først efter det nye indeks og så efter det gamle, hvis det nye indeks mangler.
Denne pakke tilbyder en Perlgrænseflade til HTS-biblioteket.
Other Packages Related to libbio-db-hts-perl
|
|
|
|
-
- dep: libbio-perl-perl
- BioPerl - grundlæggende Perlmoduler
-
- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater
-
- dep: perl (>= 5.36.0-4)
- Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
-
- dep: perlapi-5.36.0
- virtual package provided by perl-base
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
Download libbio-db-hts-perl
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| arm64 | 3.01-4+b1 | 147.7 kB | 487.0 kB | [list of files] |