all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: mummer  ]

Package: mummer (3.23+dfsg-8)

Links for mummer

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package mummer:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Efektivní uspořádání sekvencí kompletních genomů

MUMmer je systém rychlého vytváření celých genomů, ať už kompletně nebo v náčrtu. Např. MUMmer 3.0 umí najít všech 20-základních párů nebo větších shod mezi páry 5-mega základních genomů během 13,7 s, přitom využije 78 MB paměti na linuxovém počítači s 2,4 GHz CPU. MUMmer umí také uspořádat částečné genomy; umí zpracovat stovky či tisíce částí projektu s nevídanou lehkostí a uspořádat je do jiné množiny či genomu pomocí programu NUCmer obsaženého v tomto systému. Pokud jsou druhy příliš odlišné, pak může program PROmer generovat uspořádání podle překladu obou vstupních sekvencí.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::TODO, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to mummer

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download mummer

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
arm64 621.2 kB3,826.0 kB [list of files]