Package: mummer (3.23+dfsg-8 and others)

Links for mummer

Debian Resources:

Download Source Package mummer:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Steffen Moeller (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Charles Plessy (QA Page)

External Resources:

Homepage [mummer.sourceforge.net]

Similar packages:

Efektivní uspořádání sekvencí kompletních genomů

MUMmer je systém rychlého vytváření celých genomů, ať už kompletně nebo v náčrtu. Např. MUMmer 3.0 umí najít všech 20-základních párů nebo větších shod mezi páry 5-mega základních genomů během 13,7 s, přitom využije 78 MB paměti na linuxovém počítači s 2,4 GHz CPU. MUMmer umí také uspořádat částečné genomy; umí zpracovat stovky či tisíce částí projektu s nevídanou lehkostí a uspořádat je do jiné množiny či genomu pomocí programu NUCmer obsaženého v tomto systému. Pokud jsou druhy příliš odlišné, pak může program PROmer generovat uspořádání podle překladu obou vstupních sekvencí.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::TODO, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to mummer

depends

recommends

suggests

enhances

dep: gawk

GNU awk, jazyk na zpracování textu
dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, ia64, sh4]

Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
also a virtual package provided by libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.36) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.33) [alpha]

Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
also a virtual package provided by libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

Knihovna pro překladač GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

Knihovna pro překladač GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

Knihovna pro překladač GCC
dep: libstdc++6 (>= 11) [not riscv64]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

Download mummer

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	3.23+dfsg-8	654.6 kB	3,963.0 kB	[list of files]
amd64	3.23+dfsg-8	646.2 kB	3,307.0 kB	[list of files]
arm64	3.23+dfsg-8	621.2 kB	3,826.0 kB	[list of files]
armel	3.23+dfsg-8	616.5 kB	3,745.0 kB	[list of files]
armhf	3.23+dfsg-8	612.8 kB	3,361.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	3.23+dfsg-8	643.0 kB	3,175.0 kB	[list of files]
i386	3.23+dfsg-8	653.4 kB	3,297.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	3.23+dfsg-8	702.7 kB	4,138.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	3.23+dfsg-8	633.3 kB	3,193.0 kB	[list of files]
mips64el	3.23+dfsg-8	651.6 kB	4,009.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	3.23+dfsg-8	651.1 kB	4,083.0 kB	[list of files]
ppc64el	3.23+dfsg-8	655.8 kB	4,019.0 kB	[list of files]
riscv64	3.23+dfsg-8+b1	648.4 kB	3,067.0 kB	[list of files]
s390x	3.23+dfsg-8	622.6 kB	3,286.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	3.23+dfsg-8	655.9 kB	3,748.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	3.23+dfsg-8	621.6 kB	20,626.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	3.23+dfsg-8	643.1 kB	3,173.0 kB	[list of files]