Package: boxshade (3.3.1-14)

Links for boxshade

Debian Resources:

Download Source Package boxshade:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Steffen Moeller (QA Page)
Charles Plessy (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [www.ch.embnet.org]

Similar packages:

Pěkný tisk vícesekvenčních uspořádání

Boxshade je program sloužící k vytváření pěkně vypadajících tiskových sestav z různých uspořádání proteinů a sekvencí DNA. Program neřeší vlastní uspořádání a vyžaduje vstupní soubor, který je vytvořen tímto programem či ručně upraven příslušnými nástroji.

Boxshade čte sekvenční uspořádání ze souborů PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data a ESEE-save (omezených na maximálně 150 sekvencí s maximálně 10000 položkami). Program umí různá stínování na stejné/podobné zbytky. Výstup je možno zobrazovat na obrazovce ve formátech: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT a HTML.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: scope::utility, use::typesetting, Supports Format: works-with-format::html, works-with-format::plaintext, works-with-format::postscript, works-with-format::tex, Works with: Need an extra tag, Text

Other Packages Related to boxshade

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.7)

Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
also a virtual package provided by libc6-udeb

sug: kalign

Globální a progresivní nastavení seskupení

or clustalw

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

or mafft

Program pro uspořádání aminokyselin a sekvencí nukleotidů

or hmmer

Markovy modely pro analýzu proteinových sekvencí
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny
sug: texlive-latex-extra

TeX Live: LaTeX additional packages
sug: xfig

Facility for Interactive Generation of figures under X11

Download boxshade

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armel	54.6 kB	163.0 kB	[list of files]