Пакет: ska (1.0+dfsg-6 и други)

Връзки за ska

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник ska.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

Split Kmer Analysis

SKA (Split Kmer Analysis) is a toolkit for prokaryotic (and any other small, haploid) DNA sequence analysis using split kmers. A split kmer is a pair of kmers in a DNA sequence that are separated by a single base. Split kmers allow rapid comparison and alignment of small genomes, and is particulalry suited for surveillance or outbreak investigation. SKA can produce split kmer files from fasta format assemblies or directly from fastq format read sequences, cluster them, align them with or without a reference sequence and provide various comparison and summary statistics. Currently all testing has been carried out on high-quality Illumina read data, so results for other platforms may vary.

Други пакети, свързани с ska

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, loong64, ppc64el, s390x]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC support library
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ Library v3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [не armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

compression library - runtime

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Изтегляне на ska

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.0+dfsg-6	154,2 кБ	543,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.0+dfsg-6	167,7 кБ	499,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.0+dfsg-6	139,6 кБ	479,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.0+dfsg-6	135,7 кБ	478,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.0+dfsg-6	141,4 кБ	350,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1.0+dfsg-6	158,0 кБ	460,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.0+dfsg-6	175,8 кБ	534,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.0+dfsg-4	175,0 кБ	846,0 кБ	[списък на файловете]
loong64 (неофициална архитектура)	1.0+dfsg-6	149,6 кБ	479,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.0+dfsg-6	137,1 кБ	462,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.0+dfsg-6	147,0 кБ	551,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.0+dfsg-6	157,0 кБ	544,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.0+dfsg-6	158,9 кБ	543,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.0+dfsg-6	161,5 кБ	383,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.0+dfsg-6	164,3 кБ	503,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.0+dfsg-6	174,9 кБ	478,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.0+dfsg-6	137,4 кБ	1 122,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1.0+dfsg-6	164,0 кБ	478,0 кБ	[списък на файловете]