[ Източник: seqan-raptor ]
Пакет: seqan-raptor (3.0.1+ds-5 и други)
Връзки за seqan-raptor
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник seqan-raptor.
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-5.dsc]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds.orig.tar.xz]
- [seqan-raptor_3.0.1+ds-5.debian.tar.xz]
Отговорници:
Външни препратки:
- Начална страница [github.com]
Подобни пакети:
pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences
Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.
Други пакети, свързани с seqan-raptor
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- high-quality block-sorting file compressor library - runtime
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- GCC support library
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) support library
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: libyaml-cpp0.8 (>= 0.7.0)
- YAML parser and emitter for C++
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime
-
- sug: cwl-runner
- виртуален пакет, предлаган от cwltool, toil
Изтегляне на seqan-raptor
| Архитектура | Версия | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|---|
| riscv64 | 3.0.1+ds-5+b1 | 620,9 кБ | 1 560,0 кБ | [списък на файловете] |