Пакет: pbbamtools (2.4.0+dfsg-1 и други)

Връзки за pbbamtools

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник pbbam.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [pbbam.readthedocs.org]

Подобни пакети:

processing Pacific Biosciences binary alignment/map files

The BAM format is a binary, compressed, record-oriented container format for raw or aligned sequence reads. The associated SAM format is a text representation of the same data. The specifications for BAM/SAM are maintained by the SAM/BAM Format Specification Working Group.

PacBio-produced BAM files are fully compatible with the BAM specification, but makes use of the extensibility mechanisms of the BAM specification to encode PacBio-specific information.

This package provides command-line utilities for working with PacBio BAM files.

Други пакети, свързани с pbbamtools

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не ia64, m68k, sh4]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.4) [sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC support library
dep: libhts3 (>= 1.10) [m68k, sh4]

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libhts3t64 (>= 1.17) [не m68k, sh4]

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libpbbam1.3.0 (= 1.3.0+dfsg-2) [m68k, sh4]

Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
dep: libpbbam2.4.0 (= 2.4.0+dfsg-1+b2) [loong64]

Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library

dep: libpbbam2.4.0 (= 2.4.0+dfsg-1+b3) [ia64]

dep: libpbbam2.4.0 (= 2.4.0+dfsg-1+b4) [не ia64, loong64, m68k, sh4]
dep: libpbcopper1.3.0 (>= 1.4.0+dfsg) [m68k, sh4]

data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg) [не m68k, sh4]

data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не m68k, sh4]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sh4]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime

rec: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Изтегляне на pbbamtools

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	2.4.0+dfsg-1+b4	122,5 кБ	686,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	2.4.0+dfsg-1+b4	133,8 кБ	479,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2.4.0+dfsg-1+b4	116,9 кБ	619,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	2.4.0+dfsg-1+b3	145,0 кБ	712,0 кБ	[списък на файловете]
loong64 (неофициална архитектура)	2.4.0+dfsg-1+b2	119,7 кБ	459,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.3.0+dfsg-2	79,1 кБ	274,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	2.4.0+dfsg-1+b4	120,7 кБ	702,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	2.4.0+dfsg-1+b4	127,2 кБ	683,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	2.4.0+dfsg-1+b4	123,5 кБ	363,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.3.0+dfsg-2	88,0 кБ	256,0 кБ	[списък на файловете]