Пакет: fastqtl (2.184+v7+dfsg-4 и други)

Връзки за fastqtl

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник fastqtl.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [fastqtl.sourceforge.net]

Подобни пакети:

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, User Interface: interface::commandline, role::program, Purpose: Analysing

Други пакети, свързани с fastqtl

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libblas3

Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

или libblas.so.3

виртуален пакет, предлаган от libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

Boost.Iostreams Library
dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

program options library for C++
dep: libbz2-1.0 [sparc64]

high-quality block-sorting file compressor library - runtime
dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, loong64, sh4]

dep: libc6 (>= 2.39) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC support library
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC support library
dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [ia64]

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg) [не ia64]

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libgslcblas0 (>= 2.8) [sparc64]

GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [alpha, ia64, loong64, m68k, sh4]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 14) [не alpha, ia64, loong64, m68k, sh4]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: r-mathlib (>= 4.3.3) [ia64]

GNU R standalone mathematics library

dep: r-mathlib (>= 4.4.1) [не ia64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

compression library - runtime

rec: r-cran-argparser

GNU R command-line argument parser
rec: r-cran-qvalue

Пакетът не е наличен
rec: r-cran-tools

Пакетът не е наличен

sug: fastqtl-doc

QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

Изтегляне на fastqtl

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	2.184+v7+dfsg-4+b4	194,1 кБ	793,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	2.184+v7+dfsg-4+b3	237,4 кБ	790,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	2.184+v7+dfsg-4+b3	202,7 кБ	726,0 кБ	[списък на файловете]
armel	2.184+v7+dfsg-4+b3	187,2 кБ	661,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	2.184+v7+dfsg-4+b3	189,4 кБ	497,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	2.184+v7+dfsg-4+b3	199,8 кБ	644,0 кБ	[списък на файловете]
i386	2.184+v7+dfsg-4+b3	234,8 кБ	769,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	2.184+v7+dfsg-4+b2	252,5 кБ	1 260,0 кБ	[списък на файловете]
loong64 (неофициална архитектура)	2.184+v7+dfsg-4+b3	204,6 кБ	710,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	2.184+v7+dfsg-4+b3	206,0 кБ	717,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	2.184+v7+dfsg-4+b3	195,1 кБ	821,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	2.184+v7+dfsg-4+b3	213,5 кБ	854,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	2.184+v7+dfsg-4+b3	243,8 кБ	918,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	2.184+v7+dfsg-4+b3	208,9 кБ	566,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	2.184+v7+dfsg-4+b3	219,1 кБ	758,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	2.184+v7+dfsg-4+b3	257,6 кБ	726,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	2.184+v7+dfsg-4+b3	177,3 кБ	1 116,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	2.184+v7+dfsg-4+b4	238,8 кБ	741,0 кБ	[списък на файловете]