[ Източник: skewer ]
Пакет: skewer (0.2.2-6 и други)
Връзки за skewer
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник skewer.
Отговорници:
Външни препратки:
- Начална страница [github.com]
Подобни пакети:
post-processing of high-throughput DNA sequence reads
skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.
Features
* Detection and removal of adapter sequences * Insertion and deletion allowed in pattern matching * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads * Demultiplexing of barcoded sequencing runs * Multi-threading support * Trimming based on phred quality scores * IUPAC characters for barcodes and adapters * Compressed input and output support
Други пакети, свързани с skewer
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC support library
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU Standard C++ Library v3
Изтегляне на skewer
| Архитектура | Версия | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 0.2.2-6+b1 | 86,4 кБ | 216,0 кБ | [списък на файловете] |