[ Източник: pizzly ]
Пакет: pizzly (0.37.3+ds-10)
Връзки за pizzly
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник pizzly.
Отговорници:
Външни препратки:
- Начална страница [github.com]
Подобни пакети:
Експериментален пакет
Предупреждение: Този пакет е от дистрибуцията experimental. Това означава, че е възможно да е нестабилен или да има грешки, а може дори и да предизвика загуба на данни. Прочетете информация за промените и останалата документация преди да го използвате.
Identifies gene fusions in RNA sequencing data
For the interpretation of the transcriptome (the abundance and sequence of RNA) of tomour cells one is particularly interested in transcripts that cannot be mapped to single genes but that are seen to be fused as parts from two genes. Likely eplanations are chromosomal translocations.
Pizzly can identify novel such peculiarities, building on interpretations on variable splicing by the tool kallisto. Both tools are elements of the bcbio workflow.
Други пакети, свързани с pizzly
|
|
|
|
-
- dep: kallisto
- near-optimal RNA-Seq quantification
-
- dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha]
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
-
- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не alpha, riscv64, sparc64]
- GCC support library
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- compression library - runtime
-
- rec: python3-h5py
- general-purpose Python interface to hdf5
Изтегляне на pizzly
| Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|
| alpha (неофициална архитектура) | 270,6 кБ | 995,0 кБ | [списък на файловете] |
| amd64 | 306,3 кБ | 936,0 кБ | [списък на файловете] |
| arm64 | 265,5 кБ | 928,0 кБ | [списък на файловете] |
| mips64el | 259,3 кБ | 1 025,0 кБ | [списък на файловете] |
| ppc64 (неофициална архитектура) | 295,7 кБ | 1 120,0 кБ | [списък на файловете] |
| ppc64el | 298,3 кБ | 1 056,0 кБ | [списък на файловете] |
| riscv64 | 293,0 кБ | 728,0 кБ | [списък на файловете] |
| s390x | 299,1 кБ | 952,0 кБ | [списък на файловете] |
| sparc64 (неофициална архитектура) | 240,1 кБ | 1 062,0 кБ | [списък на файловете] |
| x32 (неофициална архитектура) | 306,3 кБ | 883,0 кБ | [списък на файловете] |