Пакет: canu (2.0+dfsg-1)

Връзки за canu

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник canu.

Отговорник:

Debian Med Packaging Team (Страница за QA, Пощенски архив)

Външни препратки:

Начална страница [canu.readthedocs.org]

Подобни пакети:

single molecule sequence assembler for genomes

Canu is a fork of the Celera Assembler, designed for high-noise single-molecule sequencing (such as the PacBio RS II or Oxford Nanopore MinION).

Canu is a hierarchical assembly pipeline which runs in four steps:

 * Detect overlaps in high-noise sequences using MHAP
 * Generate corrected sequence consensus
 * Trim corrected sequences
 * Assemble trimmed corrected sequences

Други пакети, свързани с canu

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: gnuplot

Command-line driven interactive plotting program.
също и виртуален пакет, предлаган от gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: libfilesys-df-perl

Module to obtain filesystem disk space information
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC support library
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU Standard C++ Library v3
dep: mhap (>= 2.1.3)

locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps
dep: perl

Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

sug: nanopolish

consensus caller for nanopore sequencing data
sug: pbgenomicconsensus

Пакетът не е наличен

Изтегляне на canu

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
mips64el	1 342,8 кБ	12 314,0 кБ	[списък на файловете]