[ Източник: libedlib ]
Пакет: edlib-aligner (1.2.6-1)
Връзки за edlib-aligner
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник libedlib.
Отговорници:
Външни препратки:
- Начална страница [github.com]
Подобни пакети:
edlib sequence alignment tool using edit distance
Edlib is a lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance. This package provides an aligner using this library.
Features of libedlib
* Calculates edit distance (Levehnstein distance). * It can find optimal alignment path (instructions how to transform first sequence into the second sequence). * It can find just the start and/or end locations of alignment path - can be useful when speed is more important than having exact alignment path. * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and infix(HW), each of them useful for different scenarios. * You can extend character equality definition, enabling you to e.g. have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to work with degenerate nucleotides. * It can easily handle small or very large sequences, even when finding alignment path, while consuming very little memory. * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.
Други пакети, свързани с edlib-aligner
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.4) [не amd64, arm64, ppc64el]
-
- dep: libedlib0 (= 1.2.6-1)
- library for sequence alignment using edit distance
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]
- GCC support library
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ Library v3
Изтегляне на edlib-aligner
Архитектура | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
---|---|---|---|
amd64 | 22,3 кБ | 65,0 кБ | [списък на файловете] |
arm64 | 21,3 кБ | 57,0 кБ | [списък на файловете] |
armel | 19,0 кБ | 52,0 кБ | [списък на файловете] |
armhf | 19,0 кБ | 48,0 кБ | [списък на файловете] |
i386 | 22,3 кБ | 64,0 кБ | [списък на файловете] |
mips64el | 21,2 кБ | 62,0 кБ | [списък на файловете] |
mipsel | 21,7 кБ | 61,0 кБ | [списък на файловете] |
ppc64el | 25,5 кБ | 85,0 кБ | [списък на файловете] |
s390x | 20,9 кБ | 61,0 кБ | [списък на файловете] |