Пакет: megadepth (1.2.0-4)

Връзки за megadepth

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник megadepth.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

computes coverage from BigWig and BAM sequencing files

A major concern for the interpretation of DNA and RNA (!) sequencing is the number of reads that cover a particular area. This package has interesting statistics for the distinction of coding and non-coding parts of the genome and knows how to interpret transcripts that span multiple exons.

This package is a successor of the program 'bamcount'.

Други пакети, свързани с megadepth

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libbigwig0 (>= 0.4.6+dfsg)

C library for handling bigWig files
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [не amd64, arm64, ppc64el]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, i386, mipsel]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libhts3 (>= 1.10)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3

sug: r-bioc-megadepth

BioCOnductor BigWig and BAM related utilities

Изтегляне на megadepth

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	78,3 кБ	266,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	68,9 кБ	274,0 кБ	[списък на файловете]
armel	68,7 кБ	273,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	69,1 кБ	209,0 кБ	[списък на файловете]
i386	81,1 кБ	273,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	68,8 кБ	281,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	70,7 кБ	279,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	81,5 кБ	338,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	70,2 кБ	262,0 кБ	[списък на файловете]