Пакет: tiddit (3.5.2+dfsg-1)

Връзки за tiddit

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник tiddit.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [github.com]

Подобни пакети:

structural variant calling

TIDDIT is a tool to used to identify chromosomal rearrangements using Mate Pair or Paired End sequencing data. TIDDIT identifies intra and inter- chromosomal translocations, deletions, tandem-duplications and inversions, using supplementary alignments as well as discordant pairs.

TIDDIT has two analysis modules. The sv mode, which is used to search for structural variants. And the cov mode that analyse the read depth of a bam file and generates a coverage report.

Други пакети, свързани с tiddit

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libc6 (>= 2.17)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.12)

dep: python3 (>= 3.11~)
dep: python3-joblib

tools to provide lightweight pipelining in Python
dep: python3-numpy

Fast array facility to the Python 3 language
dep: python3-pysam

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

Изтегляне на tiddit

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
arm64	213,8 кБ	1 187,0 кБ	[списък на файловете]