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软件包:maq(0.7.1-9) [debports]

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将短的、定长的多态性DNA序列读段比对到参考序列上

Maq(Mapping and Assembly with Quality的简称)是一款用于构建新一代测序仪产生 的短读序列到参考序列的比对组装工具。它特别针对Illumina-Solexa 1G基因分析仪进 行了优化设计,并具备初步处理ABI SOLiD数据的功能。Maq曾被称为mapass2。

Maq的开发在2008年停止,其后继者为BWA和SAMtools。

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