[ Source: ggd-utils ]
Пакунок: ggd-utils (1.0.0+ds-1 and others)
Links for ggd-utils
Debian Resources:
Download Source Package ggd-utils:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
programs for use in ggd
Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:
* a .tbi is present
* the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
line
* the VCF has a #CHROM header
* the chromosome are in the order specified by
the genome file (and present)
* the positions are sorted
* the positions are <= the chromosome lengths
defined in the genome file.
As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes
Інші пакунки пов'язані з ggd-utils
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
Завантажити ggd-utils
| Архітектура | Версія | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 1.0.0+ds-1+b17 | 2,207.2 kB | 6,605.0 kB | [список файлів] |
| arm64 | 1.0.0+ds-1+b17 | 1,894.2 kB | 6,162.0 kB | [список файлів] |
| armel | 1.0.0+ds-1+b17 | 1,965.2 kB | 6,504.0 kB | [список файлів] |
| armhf | 1.0.0+ds-1+b17 | 1,958.3 kB | 6,504.0 kB | [список файлів] |
| i386 | 1.0.0+ds-1+b17 | 2,126.7 kB | 6,428.0 kB | [список файлів] |
| ppc64el | 1.0.0+ds-1+b17 | 1,889.4 kB | 6,417.0 kB | [список файлів] |
| riscv64 | 1.0.0+ds-1+b12 | 1,963.4 kB | 6,225.0 kB | [список файлів] |
| s390x | 1.0.0+ds-1+b17 | 2,006.4 kB | 6,865.0 kB | [список файлів] |