Пакунок: libfreecontact0v5 (1.0.21-13) [debports]
Links for libfreecontact0v5
Debian Resources:
Download Source Package :
Не знайденоMaintainers:
External Resources:
- Homepage [rostlab.org]
Similar packages:
fast protein contact predictor library
FreeContact is a protein residue contact predictor optimized for speed. Its input is a multiple sequence alignment. FreeContact can function as an accelerated drop-in for the published contact predictors EVfold-mfDCA of DS. Marks (2011) and PSICOV of D. Jones (2011).
FreeContact is accelerated by a combination of vector instructions, multiple threads, and faster implementation of key parts. Depending on the alignment, 8-fold or higher speedups are possible.
A sufficiently large alignment is required for meaningful results. As a minimum, an alignment with an effective (after-weighting) sequence count bigger than the length of the query sequence should be used. Alignments with tens of thousands of (effective) sequences are considered good input.
jackhmmer(1) from the hmmer package, or hhblits(1) from hhsuite can be used to generate the alignments, for example.
This package contains the shared library implementing freecontact.
Інші пакунки пов'язані з libfreecontact0v5
|
|
|
|
-
- dep: libblas3
- Реалізації основних підпрограм лінійної алгебри (колективна бібліотека)
- or libblas.so.3
- virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libgfortran5 (>= 8)
- Виконавча бібліотека для застосунків GNU Fortran
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: liblapack3
- Бібліотека підпрограм лінійної алгебри вер. 3 — колективна версія
- or liblapack.so.3
- virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
Завантажити libfreecontact0v5
| Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|
| riscv64 (unofficial port) | 66.9 kB | 143.0 kB | [список файлів] |