Пакунок: khmer (3.0.0~a3+dfsg-9~0exp and others)

Links for khmer

Debian Resources:

Download Source Package khmer:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [khmer.readthedocs.org]

Similar packages:

Експериментальний пакунок

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

in-memory DNA sequence kmer counting, filtering & graph traversal

khmer is a library and suite of command line tools for working with DNA sequence. It is primarily aimed at short-read sequencing data such as that produced by the Illumina platform. khmer takes a k-mer-centric approach to sequence analysis, hence the name.

Tags: Biology: Fasta/Pearson, Nucleic Acids, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, implemented-in::python, User Interface: Command Line, Role: role::program, use::analysing, Purpose: Comparing, Filtering

Інші пакунки пов'язані з khmer

depends

recommends

suggests

enhances

dep: khmer-common

common files for the khmer project tools
dep: libbz2-1.0

Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль
dep: libc6 (>= 2.38)

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

Допоміжна бібліотека GCC
dep: libgomp1 (>= 4.9)

Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.13)

dep: python3 (>= 3.12~)
dep: python3-screed

short nucleotide read sequence utils in Python 3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити khmer

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	3.0.0~a3+dfsg-9~0exp+b1	7,061.4 kB	40,948.0 kB	[список файлів]