all options
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ] [  experimental  ]
[ Source: fermi-lite  ]

Пакунок: fml-asm (0.1+git20190320.b499514-2~0exp and others)

Links for fml-asm

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package fermi-lite:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Експериментальний пакунок

Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.

tool for assembling Illumina short reads in small regions

Fml-asm is a command-line tool for assembling Illumina short reads in regions from 100bp to 10 million bp in size, based on the fermi-lite library. It is largely a light-weight in-memory version of fermikit without generating any intermediate files. It inherits the performance, the relatively small memory footprint and the features of fermikit. In particular, fermi-lite is able to retain heterozygous events and thus can be used to assemble diploid regions for the purpose of variant calling.

Інші пакунки пов'язані з fml-asm

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Завантажити fml-asm

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Версія Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
alpha (unofficial port) 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 72.7 kB211.0 kB [список файлів]
amd64 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 66.0 kB155.0 kB [список файлів]
arm64 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 59.3 kB147.0 kB [список файлів]
armel 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 66.9 kB158.0 kB [список файлів]
armhf 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 66.2 kB118.0 kB [список файлів]
hppa (unofficial port) 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 81.2 kB196.0 kB [список файлів]
i386 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 84.5 kB198.0 kB [список файлів]
ia64 (unofficial port) 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 95.7 kB311.0 kB [список файлів]
m68k (unofficial port) 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 70.0 kB162.0 kB [список файлів]
mips64el 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 68.8 kB219.0 kB [список файлів]
ppc64 (unofficial port) 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 78.7 kB275.0 kB [список файлів]
ppc64el 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 76.5 kB211.0 kB [список файлів]
riscv64 0.1+git20190320.b499514-2~0exp+b1 72.4 kB132.0 kB [список файлів]
s390x 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 63.0 kB167.0 kB [список файлів]
sh4 (unofficial port) 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 91.4 kB210.0 kB [список файлів]
sparc64 (unofficial port) 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 59.8 kB1,044.0 kB [список файлів]
x32 (unofficial port) 0.1+git20190320.b499514-2~0exp 66.0 kB150.0 kB [список файлів]