all options
[  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: pairtools  ]

Пакунок: python3-pairtools-examples (0.3.0-2 and others)

Links for python3-pairtools-examples

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package pairtools:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)

Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.

Process pair-end sequence alignments and perform the following operations: 

  - Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end
    sequences of Hi-C DNA molecules
  - Sort .pairs files for downstream analyses
  - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates
  - Generate extensive statistics of Hi-C datasets
  - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria
  - Restore .sam alignments from Hi-C pairs

This package contains some examples

Інші пакунки пов'язані з python3-pairtools-examples

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Завантажити python3-pairtools-examples

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Версія Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
amd64 0.3.0-2+b2 11.8 kB50.0 kB [список файлів]
arm64 0.3.0-2+b2 11.8 kB50.0 kB [список файлів]
armel 0.3.0-2+b2 11.8 kB50.0 kB [список файлів]
armhf 0.3.0-2+b2 11.8 kB50.0 kB [список файлів]
i386 0.3.0-2+b2 11.8 kB50.0 kB [список файлів]
mips64el 0.3.0-2+b2 11.8 kB50.0 kB [список файлів]
mipsel 0.3.0-2+b2 11.8 kB50.0 kB [список файлів]
ppc64el 0.3.0-2+b2 11.8 kB50.0 kB [список файлів]
s390x 0.3.0-2+b2 11.8 kB50.0 kB [список файлів]