[ Source: stacks ]
Пакунок: stacks (2.55+dfsg-1)
Links for stacks
Debian Resources:
Download Source Package stacks:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [creskolab.uoregon.edu]
Similar packages:
pipeline for building loci from short-read DNA sequences
Stacks is a software pipeline for building loci from short-read sequences, such as those generated on the Illumina platform. Stacks was developed to work with restriction enzyme-based data, such as RAD-seq, for the purpose of building genetic maps and conducting population genomics and phylogeography.
Note that this package installs Stacks such that all commands must be run as: $ stacks <cmdname> <args>
Інші пакунки пов'язані з stacks
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libdbi-perl
- Perl-інтерфес до базданих (DBI)
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4)
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libstdc++6 (>= 9)
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
-
- rec: libspreadsheet-writeexcel-perl
- module to create Excel spreadsheets
-
- rec: littler
- GNU R scripting and command-line front-end -- transition package
also a virtual package provided by r-cran-littler
-
- rec: python3
- Інтерактивна обʼєктно-орієнтована мова високого рівня (типова версія „python3“)
Завантажити stacks
| Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|
| ppc64el | 1,033.4 kB | 6,741.0 kB | [список файлів] |