Пакунок: biobambam2 (2.0.179+ds-1)

Links for biobambam2

Debian Resources:

Download Source Package biobambam2:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [gitlab.com]

Similar packages:

tools for early stage alignment file processing

This package contains some tools for processing BAM files, including

  bamsormadup:  parallel sorting and duplicate marking
  bamcollate2:  reads BAM and writes BAM reordered such that alignment
                or collated by query name
  bammarkduplicates: reads BAM and writes BAM with duplicate alignments
                marked using the BAM flags field
  bammaskflags: reads BAM and writes BAM while masking (removing) bits
                from the flags column
  bamrecompress: reads BAM and writes BAM with a defined compression
                 setting. This tool is capable of multi-threading.
  bamsort:       reads BAM and writes BAM resorted by coordinates or
                 query name
  bamtofastq:    reads BAM and writes FastQ; output can be collated
                 or uncollated by query name

Інші пакунки пов'язані з biobambam2

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 7)

Допоміжна бібліотека GCC
dep: libgomp1 (>= 6)

Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
dep: libmaus2-2 (>= 2.0.768+dfsg)

collection of data structures and algorithms for biobambam
dep: libstdc++6 (>= 9)

Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити biobambam2

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
i386	9,888.3 kB	73,243.0 kB	[список файлів]