[ Source: mmseqs2 ]
Пакунок: mmseqs2 (12-113e3+ds-3 and others)
Links for mmseqs2
Debian Resources:
Download Source Package mmseqs2:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
ultra fast and sensitive protein search and clustering
MMseqs2 (Many-against-Many sequence searching) is a software suite to search and cluster huge proteins/nucleotide sequence sets. MMseqs2 is open source GPL-licensed software implemented in C++ for Linux, MacOS, and (as beta version, via cygwin) Windows. The software is designed to run on multiple cores and servers and exhibits very good scalability. MMseqs2 can run 10000 times faster than BLAST. At 100 times its speed it achieves almost the same sensitivity. It can perform profile searches with the same sensitivity as PSI-BLAST at over 400 times its speed.
Інші пакунки пов'язані з mmseqs2
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)
- provide functionality of zlib C-library in a C++ iostream
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
-
- dep: libzstd1 (>= 1.4.0)
- fast lossless compression algorithm
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
Завантажити mmseqs2
| Архітектура | Версія | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|---|
| armhf | 12-113e3+ds-3+b1 | 4,428.5 kB | 6,574.0 kB | [список файлів] |